Shoumetsu Toshi Sub Indo. 3 Tahun lalu, Sebuah kota yang tiba-tiba saja menghilang beserta ribuan orang yang tinggal disana saat itu. Tragedi tersebut sudah dikenal sebagai Tragedi Lost.
Takuya adalah Seorang penyeludup profesional, dan ia bertemu dengan gadis bernama Yuki merupakan satu-satunya yang selamat dari tragedi tersebut. Mereka berdua bertemu disaat Takuya menyelamatkan Yuki dari penawanan.
Keduanya pergi ke kota Lost karena sebuah pesan dari ayahnya Yuki. Tetapi untuk pergi kesana bukanlah hal yang mudah, banyak organisasi-organisasi yang akan mengincar Yuki.
Bagaimana tragedi itu bisa terjadi? dan apa sebenarnya yang ada di kota Lost itu?